Integrative Bioinformatics position
ITQB/UNL (http://www.itqb.unl.pt) is pre-selecting candidates for multiple technical and beginner investigator positions (BIC / BIT) in integrative bioinformatics as part of a 3 year FCT project in molecular epidemiology. This project merges long lasting research efforts in Semantic Web and Cloud Computing with the resources of a reference Molecular Epidemiology center. The aim of the project is obtaining a better understanding of the propagation of antibiotic resistance in pathogenic Staphylococci and Streptococci.
The research project involves collaboration both from the Biomathematics group and the Laboratory of Molecular Genetics at ITQB/Univ Nova de Lisboa, Oeiras (IGC campus) and the work is pursued in close articulation with the Algorithms group of INESC-ID at the Technical University of Lisbon (IST) and the Integrative Bioinformatics Laboratory of the University of Texas MDAnderson Cancer Center, in Houston. Significant synergism also exist between the proposed work and two EU framework projects in molecular epidemiology with multiple international partners.
Requirements
- Bachelors or Masters of Science degree (BS or MS) preferably in the interdisciplinary areas of Computer Science and Biology, including Biochemistry, Applied Chemistry or Engineering.
- Basic programming skills or willingness to learn them.
- Preference will be given to candidates that see this position as the first state towards a scientific career and an application to a PhD scholarship, or to a Masters degree.
- Working knowledge of English, willingness to travel, and desire to engage new scientific fields in a multidisciplinary environment
Functions
- Capture, represent and process experimental and field data on pathogenic Staphylococci and Streptococci generated by a larger team of researchers, including Molecular/Typing/Sequencing information.
- Aid in the continuing development of a semantically interoperable database describing tens of thousands of microbial isolates that have been, and continue to be, characterized at ITQB's Molecular Genetics Laboratory.
Complete applications consisting of a letter of application, CV, and two reference letters should be sent to Professor Jonas S. Almeida (jalmeida@mathbiol.org) and Helena Deus (hdeus@mathbiol.org). Deadline for applications is October 16th.
For more information, go to http://mathbiol.org/portugal
Posição em Bioinformática Integrativa
O ITQB (http://www.itqb.unl.pt) está a pre-seleccionar candidatos a várias bolsas técnicas e de investigação / (BIC / BIT ) em bioinformática integrativa no âmbito de um projecto de epidemiologia molecular. A temática do projecto foca-se na agregação dos esforços de investigação de longo prazo em Semantic Web e Cloud Computing com os recursos de um centro de referência em Epidemiologia Molecular. O objectivo do projecto é obtenção de conhecimento acerca da propagação da resistência a antibióticos em Staphylococci e Streptococci.
O projecto surge de um longo historial de colaboração entre o grupo de Biomatemática e o Laboratório de Genética Molecular no ITQB/Universidade Nova de Lisboa, Oeiras (campus do Instituto Gulbenkian da Ciência), e o trabalho será desenvolvido em articulação com o grupo de algoritmos INESC-ID do Instituto Superior Técnico (IST), e o Integrative Bioinformatics Laboratory (IBLab) na University of Texas MDAnderson Cancer Center em Houston. Existirá também sinergismo entre o trabalho proposto e dois projectos financiados pela União Europeia (EU Seventh Framework Programme) em epidemiologia molecular envolvendo vários parceiros internacionais.
Requerimentos
- Bacharelato ou mestrado, preferencialmente em areas multidisciplinares com componentes Computacionais ou de Biologia, incluindo Bioquímica, Química Aplicada ou Engenharia.
- Alguma familiaridade com a programação ou motivacao para aprender programação.
- Será dada preferência a candidados que pretendam seguir uma carreira científica com candidatura a bolsa de doutoramento ou enquadrem este trabalho como projecto de mestrado.
- Bom conhecimento da lingua inglesa, vontade de viajar e com motivação para estar envolvido em novos campos científicos num ambiente multidisciplinar
Funções
- A captura, representação e processamento de dados recolhidos experimentalmente na área da patogenecidade de Staphylococci e Streptococci gerado por uma equipa de instestigadores no Laboratório de Genética Molecular, incluindo dados Moleculares/Tipagem/Sequenciação.
- Colaboração no desenvolvimento contínuo de um sistema de informação semanticamente interoperável onde dezenas de milhares de estirpes recolhidas foram já recolhidas e inseridas pelo Laboratório de Genética Molecular do ITQB
As candidaturas deverão ser enviadas, juntamente com uma carta de aplicação do candidato, CV e duas cartas de refêrencias, para o Professor Jonas S. Almeida (jalmeida@mathbiol.org) e Helena Deus (hdeus@mathbiol.org). Deadline para aplicações a 16 de Outubro.
Para mais informação ir a http://mathbiol.org/portugal.